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@dsh-bio/dsh-bio-genie
v0.1.4 · 2 天前发布
生物信息学「许愿式分析」插件：BioPython 全功能覆盖（任意代码执行器 bio_python + 14 个领域 skill）+ 高频语义化工具 + 零依赖自举 Python 环境（uv + venv + biopython 自动下载到插件私有目录）。用户下载安装即可许愿式分析。
README
🧬 dsh-bio-genie
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中文 | English
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面向 DeepSeek Harness (dsh) 的生物信息学「许愿式分析」插件
dsh bio analysis · dsh biology analysis · deepseek harness bioinformatics · Biopython · sequence analysis · genomics
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说人话，出结果。用户用自然语言描述生物学分析需求，dsh 的 agent 自动完成分析。
下载安装即用 —— 无需用户安装 Python 或 Biopython，插件首次运行自动引导完全隔离的 Python 环境。
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✨ 特性
| 特性 | 说明 |
|------|------|
| 🪄 许愿式分析（Wish Coding） | 说人话就能分析："这条序列的 GC 含量和 EcoRI 酶切位点？" |
| 🧩 全功能覆盖 | bio_python 执行器可运行任意 Biopython 代码（比对、PDB、Phylo、motif、BLAST…），配合 14 个领域 skill 配方 |
| ⚡ 高频语义化工具 | 11 个固定参数工具（GC 含量、翻译、限制酶、k-mer、文件 IO、Entrez…）——省 token、输出稳定、参数有校验 |
| 📦 零安装 | 自动下载隔离的 Python 环境（uv + venv + Biopython）到 $DSH_HOME/dsh-bio-genie/，不污染系统 |
| 🇨🇳 国内网络友好 | `DSH_BIO_UV_
版本兼容矩阵
| DSH 版本 | 状态 | 说明 |
|---|---|---|
dsh@0.1.0-rc.6 | ✅ 兼容 | cordis patch ✅ |
dsh@0.1.0 | ✅ 兼容 | 标准 patch ✅ |
dsh@0.2.0 | ⚠️ 待验证 | 待实测（API 可能在变） |
dsh@0.3.0+ | ❓ 未知 | 尚未发布 |
💡 兼容矩阵每周末自动跑实测，欢迎 PR 修正
元数据
- License
- MIT
- npm
- @dsh-bio/dsh-bio-genie
- Repo
- git+https://github.com/moonbowterfly/dsh-bio-genie.git
- Engines
{"node":"^22.19 || >=24"}- Weekly DL
- 0
- Monthly DL
- 0
- dsh.bundle
{"bundle":{"patch":"./cordis.patch.yml"}}